Menéndez consiguió varios contratos con el Gobierno durante la gestión de Funes, quien actualmente es investigado por delitos vinculados con corrupción y enfrenta un proceso civil por presuntamente haberse enriquecido ilícitamente junto a su hijo, Roberto Funes Cañas, y la exprimera dama, Vanda Pignato. Actualmente se encuentra asilado políticamente en Nicaragua, al igual que Funes Cañas. La audiencia probatoria está programada para el próximo 17 de enero de 2017.
La Sección de Probidad de la Corte Suprema de Justicia encontró un aumento en el patrimonio de Funes de $552,669 durante su gestión presidencial (2009-2014), de $57,060 en el de Pignato (con el que canceló sus deudas), y de $118,600 en el del hijo del exmandatario.